Pada 1997, ketika usianya masih 20 tahun, Najwa Shihab menikah dengan seniornya yang bertemu di UI, Ibrahim Sjarief Assegaf.
Dari pernikahan tersebut, Najwa Shihab dikaruniai dua orang anak, Izzat Ibrahim Assegaf dan Namiyah.
Namun Namiyah yang lahir pada 2011 telah meninggal dunia empat jam selepas dilahirkan.
Najwa Shihab tinggal di komplek rumah keluarganya di daerah Cilandak Timur, Jakarta Selatan.
Rumah Najwa Shihab, para saudara, dan orang tuanya berada di satu komplek dan dihubungkan dengan lorong di belakang dan samping rumah masing-masing.
Najwa Shihab menghabiskan masa kecilnya di Makassar, sebelum akhirnya pindah ke Jakarta ketika usianya menginjak remaja.
Najwa Shihab mengenyam bangku TK di TK Al-Quran Makassar sebelum masuk ke sekolah dasar pada 1984.
Pendidikan dasarnya ditempuh di Madrasah Ibtidaiyah (MI) Nurul Hidayah hingga lulus pada 1990.
Baca: 5 Rekomendasi Buku Bacaan Ringan dari Najwa Shihab untuk Usir Rasa Bosanmu
Najwa Shihab kemudian melanjutkan sekolahnya di Jakarta, yaitu di SMP Al-Ikhlas Jeruk Purut, Jakarta Selatan sampai 1993. (4)
Lulus dari SMP, Najwa Shihab melanjutkan ke SMA Negeri 6 Jakarta.
Ketika kelas dua SMA, Najwa Shihab mengikuti program pertukaran pelajar bernama AFS yang dikelola oleh Yayasan Bina Antarbudaya.
Najwa Shihab kemudian terpilih sebagai siswa yang diberangkatkan ke Amerika selama satu tahun.
Sebelum berangkat ke Amerika, sempat terjadi pertentangan di dalam keluarganya.
Sang ibu, Fatmawati Assegaf tidak memberikan izin kepada Najwa Shihab yang masih berusia 16 tahun untuk berangkat dan tinggal sendiri di Amerika Serikat.
Namun berbeda dengan sang ayah, Prof Quraish Shihab yang justru memberikan lampu hijau.
Menurut Prof Quraish Shihab, pendidikan adalah nomor satu.
Akhirnya setelah melewati diskusi panjang, keluarga merelakan Najwa Shihab untuk berangkat ke Amerika.
Lulus dari SMA, Najwa Shihab kemudian memilih untuk melanjutkan kuliah di Fakultas Hukum Universitas Indonesia (UI).
Mengambil jurusan Ilmu Hukum, Najwa Shihab berhasil meraih gelar sarjananya pada tahun 2000.
Najwa Shihab mendapat beasiswa Australian Leadership Award dari Pemerintah Australia.