Setelah itu, Mohammad Ahsan dipasangkan dengan Hendra Setiawan.
Pada tahun 2012, Mohammad Ahsan dan Hendra Setiawan memulai debut sebagai ganda putra bulutangkis Indonesia dalam pertandingan Yonex Denmark Open Super Series Premiere.
Pasangan Mohammad Ahsan dan Hendra Setiawan meraih gelar juara dunia pada tahun 2013.
Baca: Momen Kunci Greysia/Apriyani Rebut Emas Olimpiade 2020, Saling Motivasi hingga Balas Psywar Lawan
Setahun kemudian, Mohammad Ahsan meraih juara All England 2014.
Prestasinya berlanjut pada tahun 2015, Mohammad Ahsan meraih juara dunia.
Hingga pada tahun 2016, Mohammad Ahsan dipasangkan dengan Agung Saputro. (5)
Namun tak bertahan lama, Mohammad Ahsan kembali dipasangkan dengan Hendra Setiawan.
Pasangan ini berhasil menaiki podium sebagai juara All England 2019.