Tetapi mereka juga menggambarkan penyelidikan itu sebagai langkah penting menuju keadilan untuk kejahatan yang dituduhkan dan tak termaafkan.
Perdana Menteri Austalia Scott Morrison pekan lalu mengatakan kepada warga Australia untuk bersiap menghadapi kebenaran yang jujur dan brutal dalam dokumen tersebut.
Ia menelepon Presiden Afghanistan Ashraf Ghani untuk memperingatkannya tentang tuduhan yang mengganggu yang ditanggapi dengan sangat serius oleh pemerintah Australia.
Kantor Ghani mengatakan Morrison telah menyatakan kesedihannya yang paling dalam atas kesalahan tersebut.
Morrison sebelumnya telah mengumumkan penyelidik khusus akan mengejar kemungkinan tuntutan pidana.
Setelah bukti dikumpulkan, itu akan diteruskan ke direktur penuntutan publik Australia untuk menentukan apakah dakwaan dibeli.
Reynolds mengatakan pekan lalu bahwa Canberra telah diberitahu bahwa penuntutan di Australia akan meniadakan dakwaan di Pengadilan Kriminal Internasional di Den Haag.
Komisi hak asasi manusia Afghanistan mengutuk pembunuhan dan kebrutalan yang disebutkan dalam laporan itu.
Laporan tersebut 'dengan jelas menunjukkan bahwa pasukan Australia terlibat dalam pembunuhan dan kebrutalan terhadap warga Afghanistan, termasuk anak-anak, melalui tindakan kekerasan yang disengaja dan tidak manusiawi di balik konsensus bahwa kehidupan Afghanistan, baik laki-laki, perempuan atau anak-anak, tidak memiliki harga diri atau martabat,' kata komisi itu.
"Hanya melalui serangkaian penyelidikan independen kami akan mengungkap sejauh mana sebenarnya pengabaian terhadap kehidupan Afghanistan ini, yang menormalkan pembunuhan, dan mengakibatkan kejahatan perang."
Direktur Human Rights Watch Australia Elaine Pearson mengatakan kepada Al Jazeera bahwa para korban Afghanistan berhak mendapatkan keadilan yang cepat dan independen atas pembunuhan yang disengaja dan berdarah dingin.
Berbicara kepada BBC, Pearson berkata: "Pada akhirnya, jika kita berbicara tentang akuntabilitas, ini seharusnya tidak hanya berhenti pada orang-orang yang menarik pelatuk dan membunuh orang-orang ini di Afghanistan."
"Ini juga tentang tanggung jawab komando dan jadi saya pikir sangat penting bahwa mereka yang tahu atau yang seharusnya tahu juga dimintai pertanggungjawaban dan dimintai pertanggungjawaban pidana atas tindakan ini."
"Karena pada akhirnya, ini adalah budaya di mana pembunuhan dinormalisasi, dalam beberapa kasus, didorong. Budaya itu benar-benar perlu diubah."
Amnesty International Australia mengatakan meskipun penting untuk menegakkan keadilan, keluarga para korban harus mendapat prioritas yang sama.
"Dampak penuh terhadap keluarga dan komunitas dari 39 pembunuhan ini harus dieksplorasi sepenuhnya dan dukungan yang tepat diberikan kepada keluarga dan komunitas tersebut," kata mereka.
Gubernur Jenderal Australia David Hurley, yang merupakan kepala Australia Defense Force (ADF) ketika dugaan kejahatan perang dilakukan, menyampaikan belasungkawa kepada keluarga korban Afghanistan.
Dia mengatakan kekejaman yang tak termaafkan dilakukan oleh sejumlah kecil individu dan sengaja disembunyikan dari rantai komando langsung.
Mantan Perdana Menteri Australia Kevin Rudd mengatakan dia muak bahwa tentara Australia yang bertugas di Afghanistan bisa melakukan pembunuhan berdarah dingin.
Rudd adalah pemimpin Australia selama bagian dari keterlibatan militer di Afghanistan.