Disana Bong Joon Ho sering membuat film pendek dengan menggunakan kamera 16mm.
Dua film Bong Joon Ho untuk kelulusan yaitu Memory Within the Frame dan Incoherence diundang screening di Vancouver dan Hong Kong International Film Festivals.
Selama lima tahun pasca lulus dari Korean Academy of Film Art, Bong Joon Ho masih bekerjasama dengan sutradara lain untuk menggarap film.
Bong Joon Ho berkontribusi dalam penulisan skenario film bersama seperti : Seven Reasons Why Beer is Better Than My Lover (1996), Park Ki-yong’s Motel Cactus (1997), Save the Green Planet!, Phantom the Submarine (1999).
Film pertama Bong Joon Ho adalah Barking Dogs Never Bite yang diproduseri oleh Cha Seung Jae.
Film tersebut menceritakan seorang dosen yang menculik anjing tetangganya dan cerita kompleks di sebuah apartemen tempat Bong Joon Ho tinggal setelah menikah.
Walaupun Film Bong Joon Ho tersebut kurang mendapat respon dari penonton di Korea Selatan, namun film tersebut diundang di San Sebastian International Film Festival dan memenangkan penghargaan di Slamdance and Hong Kong.
Berkat penghargaan dan penjualan di internasional, film Bong Joon Hon tersebut bisa melunasi biaya produksi yang selama dua tahun pascaproduksi belum terlunasi.
Film kedua Boong Joon Ho adalah Memories of Murder yang rilis 2003.
Film tersebut merupakan proyek film sekala besar yang diadaptasi dari peristiwa nyata pembunuhan berantai di Provinsi Yeonggi antara tahun 1986 hingga 1991.
Proses pembuatan film yang lama dan mengalami banyak rintangan karena tempat syuting yang bermacam-macam membuahkan hasil, karena nama Bong Joon Ho menjadi perbincangan di Korea Selatan melalui film tersebut.
Film Memories of Murder terjual lebih dari lima juta tiket dan mendapat penghargaan sebagai Best Picture, Best Director, Best Actor (Song Kang Ho) dan Best Lighting di Grand Bell Award di Korea Selatan 2003.
Meskipun tidak diundang di Cannes Festival Film dan Venice Festival Film, film besutan Bong Joon Ho ini menerima premier internasionalnya kembali di San Sebastian.
Di sana Memories of Murder mendapatkan tiga penghargaan film termasuk Bong Joon Ho sebagai sutradara terbaik.
Memories of Murder juga menerima sambutan kritik yang luar biasa kuat pada perilisannya di negara asing seperti Prancis dan Amerika Serikat.
Film selanjutnya adalah The Host yang merupakan ambisi baru karier Bong Joon Ho di industri film Korea Selatan.
Film tersebut memiliki anggaran USD 12 juta yang menceritakan perjuangan satu keluarga melawan seekor monster yang tumbuh di Sungai Han dan mengamuk di Kota Seoul.